伊斯兰教于宋末元初开始传入湖南，最早可追溯到宋德佑二年（1276年）。元朝时期，曾有少数穆斯林朝廷命官入湘，明代亦有一批穆斯林将士入湘，清代及民国时期，又有大批穆斯林因经商、躲避战乱而迁徙湖南。据史料记载：元至元十三年（1276）始，回回人阿里汗、乌尔马、剌马丹（勘马剌丁）、撒的迷失、撒里蛮、博兰台、曲烈、罗里、马某沙、阿里兰、马合谋、马成等相继来湘出仕。明洪武年间，有大量回维族穆斯林将士入湘定居。明太祖朱元璋赐封了一批从戎入湘的穆斯林将领，如璞罗德（赐姓张）、苏通、海盟石、蔡能、哈勒八十（赐姓翦）、马德成等人，他们分别落籍于宝庆和常德两地，这些明初入湘的穆斯林将领及其带领的穆斯林士兵成为伊斯兰教传入湖南的主要渊源。明末清初又有许多穆斯林商贩、避难逃荒者随李自成农民起义军来湘，迁至长沙、常德、益阳、衡阳、湘潭、岳阳、及沅陵、泸溪等地定居。抗日战争期间，又有大批穆斯林因战乱迁徙湖南。至民国三十年（1941），湖南省有回族穆斯林20余万人，清真寺80余座。   全省现有回维族穆斯林14.3万余人。其中维族穆斯林1万余人，主要聚居在常德桃源县；回族穆斯林13万余人，主要分布情况为：常德市6万余人，邵阳市近4万人，益阳市1.2万余人，其他分别散居在长沙、株洲、湘潭、衡阳、岳阳、怀化、张家界市和湘西自治州。在邵阳、常德、益阳三个穆斯林相对聚居的市，建立有隆回县山界回族乡，桃源县枫树维回族乡、青林回维族乡，桃江县鲊埠回族乡，汉寿县毛家滩回维族乡，鼎城区许家桥回维族乡等6个穆斯林民族乡。

全省现有具备阿訇资格的伊斯兰教教职人员49人。有经登记、开放的清真寺68座，分别为邵阳市24座，常德28座，益阳3座，怀化、长沙各2座，衡阳、株洲、湘潭、岳阳各1座。有伊协、回管会、伊协筹备组等各级伊斯兰教组织22个，分别是长沙、常德、邵阳、株洲、湘潭、岳阳、益阳等7个市级伊协，邵阳、邵东、隆回、桃源、汉寿、鼎城、津市、桃江、新晃、安乡、澧县等11个县级伊协，以及衡阳市、张家界市、南县等3个回民管委会和凤凰县伊协筹备组。

湖南省伊斯兰教协会成立于1985年5月，会址设于长沙市，现为第六届委员会，内设办公室、文教委员会、教务委员会、经济委员会、《湖南回维族穆斯林》编辑部等机构。近年来，在省委、省政府的领导下，在省委统战部、省宗教局的具体指导下，省伊协高举爱国爱教旗帜，在协助党和政府宣传、贯彻民族宗教政策，贯彻落实两个《宗教事务条例》，加强自身建设、人才培养，参与抗灾救灾、扶贫助学，加强民族团结，维护社会稳定，抵御宗教渗透，维护穆斯林的合法权益，组织开展伊斯兰教教务活动等方面做了大量的卓有成效的工作，为构建和谐湖南，推进富民强省作出了积极的贡献。 例如在服务社会的工作方面，省伊协曾引进外资6.5万美元，帮助桃江县鲊埠回族乡民族中学援建了一座教学楼；积极参与抗冰救灾、抗震救灾、抗洪救灾、扶贫助学等社会慈善公益事业，先后捐资、捐物共计100余万元，并到我省郴州洪灾区、四川地震灾区慰问灾民；协助各地政府妥善处理了涉及伊斯兰教包括西北来湘经商的穆斯林方面的矛盾纠纷150余起，切实地维护了我省民族团结和社会稳定。又如在自身建设方面，我会从世界伊斯兰发展银行争取25万美元无偿援助，又得到省财政支持800余万元，购置并改造了集办公、教育培训、自养为一体的占地面积1200余平方米，建筑面积为2300余平方米的综合楼，极大地改善了我会办公、教育培训和自养的条件；举办了多期阿訇培训班、新“卧尔兹”演讲比赛、《古兰经》诵读比赛、电脑培训班等，进一步提高了我省伊斯兰教教职人员的综合素质；开展了和谐清真寺的创建，加强了“清真三食”的监督管理，为构建和谐湖南推进富民强省发挥了积极作用。